
- 作 者:王峥峰著
- 出 版 社:北京:科学出版社
- 出版年份:2016
- ISBN:9787030464781
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第一部分 分子生态学理论 3
第一章 分子生态与遗传变异 3
第一节 遗传变异的产生 3
第二节 分子标记的种类 5
第三节 遗传变异的衡量 7
第四节 遗传变异的维持、丧失 11
第二章 分子生态学研究内容 18
第一节 个体与物种区分、鉴定(差异与多样性) 18
第二节 基因流和适应 23
第三节 小种群 28
第二部分 分子生态数据获得与分析——以微卫星体分子标记为例 35
第三章 分子遗传标记的获得——微卫星体 35
第一节 微卫星体获得:MsatCommander、inGAP、MicroFamily和GelQuest软件 35
第二节 微卫星体数据初步整理分析:GenAlEx软件及其遗传多样性大小衡量 55
第四章 遗传变异状况 61
第一节 Hardy-Weinberg平衡检测:Genepop、SGoF+软件 61
第二节 连锁不平衡检测:Genepop软件 68
第三节 等位基因丰富度比较:ADZE软件 70
第五章 遗传分化 74
第一节 FST分析:Genetix软件 74
第二节 AMOVA分析:GenAlEx软件 78
第六章 分组分析 83
第一节 Structure软件分析及CONVERT、Structure Harvester、CLUMPP软件 83
第二节 TESS软件分析及PAST、TESS Ad-Mixer软件 114
第七章 空间遗传结构分析 132
第一节 sPCA分析 132
第二节 Alleles in space和Surfer软件 149
第三节 空间自相关分析:SPAGeDi软件 159
第四节 空间遗传结构的异向性:PASSaGE软件和R程序 166
第八章 景观遗传学分析 183
第一节 表面距离:ArcGIS软件 183
第二节 加权线性距离、最小成本距离和阻抗距离:R程序 198
第三节 Mantel test和Partial Mantel test:PASSaGE软件 206
参考文献 214