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免疫信息学  计算机辅助预测免疫原性  典藏版
  • 作 者:(英)D.R.弗劳尔主编;吴玉章译
  • 出 版 社:北京:科学出版社
  • 出版年份:2016
  • ISBN:9787030474872
  • 标注页数:279 页
  • PDF页数:292 页
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1免疫信息学与计算机辅助预测免疫原性:导论 1

第1部分 数据库 10

2国际免疫遗传学信息系统(IMGT) 10

3IMGT/HLA数据库 27

4免疫多态性数据库:IPD 39

5T细胞表位查询和预测数据库:SYFPEITHI 49

6T细胞表位、MHC结合肽和TAP结合肽的搜寻及描图 61

7Bcipep数据库中B细胞表位的搜寻及描图 75

8半抗原、载体蛋白和抗半抗原抗体的检索 84

第2部分 HLA超型鉴定 95

9基于GRID/CPCA和层次聚类法的HLA超型分类 95

10HLA-A2超型的结构基础 104

11基于MHC结合肽库定义MHC超型 110

12基于肽结合凹槽静电分布图的HLA-I类等位基因分型 117

第3部分 肽与MHC结合能力的预测 123

13特征参数法预测MHC结合肽 123

14机器学习技术预测MHC结合肽 133

15人工智能方法预测T细胞表位 144

16小鼠MHC-多肽亲和力的预测 150

17 3D-QSAR模型预测MHC-多肽亲和力 164

18基于MHC分子模型预测表位肽 175

19基于支持向量机预测MHC结合肽 182

20应用SVRMHC方法预测多肽与MHC分子的结合亲和力 189

21基于结构及分子模拟预测HLA结合肽 195

22基于结构预测MHC结合肽操作指南 200

23MHC-Ⅰ及MHC-Ⅱ与肽结合的静态能分析 206

24分子动力学模拟 214

25一种预测MHC-Ⅱ类分子结合肽的迭代方法 229

26MHC-Ⅱ类分子结合肽综合预测方法 237

27基于贝叶斯神经网络的MHC-Ⅱ类分子-肽复合物非线性预测模型 244

第4部分 免疫系统其他特性的预测 253

28TAPPred法预测抗原中的TAP结合肽 253

29B细胞表位的预测方法 257

30一种MHC分子结构功能相似性分析平台:HistoCheck 263

31免疫相关性毒力因子的预测 271

索引 278

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