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生物信息学方法指南
  • 作 者:(加)S.米塞诺,(美)S.A.克拉维茨著;欧阳红生,阮承迈,李慎涛等译
  • 出 版 社:北京:科学出版社
  • 出版年份:2005
  • ISBN:7030144651
  • 标注页数:408 页
  • PDF页数:417 页
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目录 1

前言 1

编写成员 1

第一部分 序列分析软件包 1

1 GCG:序列分析程序威斯康星软件包 3

2 GCG序列分析程序基于网页的界面 19

3 Omiga:一种基于PC机的序列分析工具 26

4 MacVector:Macintosh计算机集成序列分析软件 38

5 DNASTAR的Lasergene序列分析软件 56

6 PepToolTM和GeneToolTM:非平台依赖性的生物序列分析工具 74

7 Staden软件包,1998 91

8 利用免费软件建立多用户序列分析系统 104

第二部分 分子生物学软件 117

9 Macintosh和MS Windows计算机分子生物学方面的免费软件 119

10 用FASTA3程序软件包进行灵活的序列相似性搜索 158

11 采用CLUSTAL W和CLUSTAL X进行多序列比对 185

12 用PHYLIP进行系统发生学分析 204

13 使用Genotator注释序列数据 218

14 低价位的凝胶分析系统 233

第三部分 网络信息资源 243

15 供临床遗传学者和分子遗传学者使用的计算机资源 245

16 NCBI网页上的公用工具和资源 253

17 EBI上的资源 264

18 计算机辅助分析转录调控区域:MatInspector和其他程序 284

19 计算机辅助的基因鉴定 294

20 万维网上适用于一般用户和生物学工作者的Primer3程序 306

21 利用万维网装备分子生物学实验室 327

第四部分 计算机和分子生物学:信息发布与限制 337

22 网络计算 339

23 利用DNA进行计算 349

24 检测生物模式:整合数据库、模型和算法 363

第五部分 生物信息学教学与最新文献跟踪 375

25 分子生物学和遗传学的计算机应用入门课程的设计与实施 377

26 虚拟图书馆Ⅰ:MEDLINE搜索 387

27 虚拟图书馆Ⅱ:科学引文索引和更新通告服务 395

28 虚拟图书 Ⅲ:电子期刊、赠款、基金资助信息 402

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