病毒分类学

第1章　病毒学研究简史 3

一、病毒的发现 3

第一编　病毒分类学概况 3

二、病毒学研究的进展 4

三、病毒学研究的发展趋势 7

第2章　病毒分类现状 10

一、病毒的主要类群 10

二、病毒分类单元 12

四、病毒分类的依据 13

三、病毒名称的书写方式 13

五、病毒分类命名发展趋势 14

六、病毒分类系统 15

第二编　脊椎动物病毒 29

第3章　脊椎动物DNA病毒 29

一、痘病毒科（Poxviridae）脊椎动物痘病毒亚科（Chordopoxvirinae） 29

二、非洲猪瘟病毒科（Asfarviridae） 36

三、虹彩病毒科（Iridoviridae）脊椎动物病毒成员 37

四、疱疹病毒科（Herpesviridae） 42

五、腺病毒科（Adenoviridae） 58

六、乳头瘤状病毒科（Papovaviridae） 64

七、多瘤病毒科（Polyomaviridae） 74

八、细小病毒科（Parvoviridae）细小病毒亚科 77

九、圆环病毒科（Circovirudae） 83

十、指环病毒属（Anellovirus） 85

第4章　脊椎动物反转录病毒 95

一、嗜肝DNA病毒科（Hepadnaviridae） 95

二、反转录病毒科（Retroviridae） 100

一、呼肠孤病毒科（Reoviridae） 116

第5章 脊椎动物双链RNA病毒 116

二、双节段RNA病毒科（Birnaviridae）脊椎动物病毒成员 134

第6章 脊椎动物负链RNA病毒 142

一、单分子负链RNA病毒目副黏病毒科（Paramyxoviridae） 142

二、单分子负链RNA病毒目丝状病毒科（Filoviridae） 152

三、单分子负链RNA病毒目弹状病毒科（Rhabdoviridae） 157

四、单分子负链RNA病毒目博尔纳病毒科（Bornaviridae） 166

五、正黏病毒科（Orthomyxoviridae） 169

六、布尼亚病毒科（Bunyaviridae） 177

七、沙粒病毒科（Arenaviridae） 193

八、丁型肝炎病毒属（Deltavirus） 198

第7章 脊椎动物正链RNA病毒 205

一、披膜病毒科（Togaviridae） 205

二、黄病毒科（Flaviviridae） 212

三、成套病毒目冠状病毒科（Coronaviridae） 223

四、成套病毒目动脉炎病毒科（Arteriviridae） 228

五、杯状病毒科（Caliciviridae） 230

六、微RNA病毒科（Picornaviridae） 236

七、星状病毒科（Astroviridae） 250

八、野田村病毒科（Nodaviridae）乙型野田村病毒属（Betanodavirus） 252

九、戊型肝炎病毒属（Hepatitis E virus） 255

第三编 昆虫和其他无脊椎动物病毒 265

第8章 昆虫DNA病毒 265

一、杆状病毒科（Baculoviridae） 265

二、多分体DNA病毒科（Polydnaviridae） 290

三、痘病毒科昆虫痘病毒亚科（Entomopoxvirinae） 293

四、泡囊病毒科（Ascoviridae） 296

五、虹彩病毒科（Iridoviridae）昆虫虹彩病毒 298

六、细小病毒科（Parvoviridae）浓核症病毒亚科（Densovirinae） 301

第9章 昆虫DNA和RNA反转录病毒 308

一、变位病毒科（Metaviridae）昆虫病毒成员 308

二、前病毒科半病毒属（Hemivirus） 312

第10章　昆虫RNA病毒 315

一、呼肠孤病毒科（Reoviridae）昆虫病毒成员 315

二、双节段RNA病毒科（Birnaviridae）昆虫病毒成员 320

三、双顺反子病毒科（Dicistroviridae） 321

四、野田村病毒科（Nodaviridae）甲型野田村病毒属 323

五、四体病毒科（Tetraviridae） 325

六、传染性软腐病病毒属（Iflavirus） 328

第11章 甲壳动物和其他无脊椎动物病毒 332

一、线头病毒科（Nimaviridae） 332

二、杆状套病毒科（Roniviridae） 336

三、其他甲壳动物病毒（Other Crustacea viruses） 337

四、其他无脊椎动物病毒（Other invertebrate viruses） 337

第四编　植物病毒 343

第12章　植物DNA病毒和反转录病毒 343

一、双生病毒科（Geminiviridae） 343

二、矮缩病毒科（Nanoviridae） 368

三、花椰菜花叶病毒科（Caulimoviridae） 370

四、前病毒科（Psedoviridae）植物病毒成员 376

五、变位病毒科（Metaviridae）植物病毒成员 378

第13章　植物双链RNA病毒 381

一、呼肠孤病毒科（Reoviridae）植物病毒成员 381

二、双组分RNA病毒科（Partitiviridae）植物病毒成员 384

三、内源RNA病毒属（Endornavirus） 386

第14章　植物负链RNA病毒 389

一、弹状病毒科（Rhabdoviridae）植物病毒成员 389

二、布尼亚病毒科（Bunyaviridae）植物病毒成员 391

三、蛇形病毒属（Ophiovirus） 393

四、纤细病毒属（Tenuivirus） 394

五、巨脉病毒属（Varicosavirus） 396

第15章　植物正链RNA病毒 399

一、伴生病毒科（Sequiviridae） 399

二、豇豆花叶病毒科（Comoviridae） 400

三、马铃薯Y病毒科（Potyviridae） 408

四、番茄丛矮病毒科（Tombusviridae） 421

五、黄症病毒科（Luteoviridae） 428

六、雀麦花叶病毒科（Bromoviridae） 432

七、长线形病毒科（Closteroviridae） 437

八、芜菁黄花叶病毒科（Tymoviridae） 441

九、线形病毒科（Flexiviridae） 445

十、烟草花叶病毒属（Tobamovirus） 454

十一、烟草脆裂病毒属（Tobravirus） 458

十二、大麦病毒属（Hordeivirus） 459

十三、真菌传杆状病毒属（Furovirus） 460

十四、马铃薯帚顶病毒属（Pomovirus） 461

十五、花生丛簇病毒属（Pecluvirus） 462

十六、甜菜坏死黄脉病毒属（Benyvirus） 463

十七、南方菜豆花叶病毒属（Sobemovirus） 464

十八、欧尔密病毒属（Ourmiavirus） 466

十九、悬钩子病毒属（Idaeovirus） 466

二十、伞形病毒属（Umbravirus） 467

二十一、温州蜜柑矮缩病毒属（Sadwavirus） 468

二十二、樱桃锉叶病毒属（Cheravirus） 469

第五编 原核生物、真菌、原生动物和藻类病毒 475

第16章　单链DNA噬菌体 475

一、丝杆状噬菌体科（Inoviridae） 475

二、微小噬菌体科（Microviridae） 479

第17章　双链DNA噬菌体 488

一、有尾噬菌体目（Caudovirales）肌尾噬菌体科（Myoviridae） 488

二、有尾噬菌体目（Caudovirales）长尾噬菌体科（Siphoviridae） 502

三、有尾噬菌体目（Caudovirales）短尾噬菌体科（Podoviridae） 513

四、复层噬菌体科（Tectiviridae） 519

五、覆盖噬菌体科（Corticoviridae） 522

六、芽生噬菌体科（Plasmaviridae） 523

七、脂毛噬菌体科（Lipothrixviridae） 525

八、小纺锤形噬菌体科（Fuselloviridae） 527

九、小杆状噬菌体科（Rudiviridae） 529

十、微滴形噬菌体科（Guttaviridae） 530

十一、盐末端蛋白噬菌体属（Salterprovirus） 530

第18章　RNA噬菌体 534

一、囊状噬菌体科（Cystoviridae） 534

二、光滑噬菌体科（Leviviridae） 538

第19章　真菌和原生动物病毒 543

一、单组分RNA病毒科（Totiviridae） 543

二、双组分RNA病毒科（Partiviridae） 547

四、低毒病毒科（Hypoviridae）真菌病毒成员 550

三、产黄青霉病毒科（Chrysoviridae） 550

五、杆状RNA病毒科（Barnaviridae） 552

六、裸露RNA病毒科（Narnaviridae） 553

七、根前毛菌病毒属（Rhizidiovirus） 556

八、变位病毒科（Metaviridae）变位病毒属（Metavirus） 556

九、前病毒科（Pseudoviridae）真菌病毒 557

十、呼肠孤病毒科（Reoviridae）真菌病毒成员 560

十一、拟态病毒属（Mimivirus） 561

一、藻类DNA病毒科（Phycodnaviridae） 568

第20章　藻类病毒 568

二、海洋RNA病毒科（Marnaviridae） 578

三、前病毒科（Pseudoviridae）藻类病毒成员 578

第六编 类病毒、卫星体和朊病毒 583

第21章　类病毒 583

一、马铃薯纺锤形块茎类病毒科（Pospiviroidae） 584

二、鳄梨日斑类病毒科（Avsunviroidae） 588

第22章　卫星体和朊病毒 591

一、卫星体（satellites） 591

二、朊病毒（prion） 595