基因组 3

第1篇 研究基因组 3

第1章 基因组、转录组和蛋白质组 3

DNA 5

RNA和转录组 14

蛋白质和蛋白质组 17

总结 24

第2章 研究DNA 30

用于DNA操作的酶 33

DNA克隆 44

聚合酶链反应（PCR） 56

总结 59

第3章 基因组作图 66

遗传图谱和物理图谱 68

遗传作图 69

物理作图 88

总结 101

第4章 基因组测序 107

DNA测序方法学 108

连续DNA序列的组装 116

人类基因组计划 125

总结 128

第5章 解读基因组序列 134

在基因组序列中定位基因 135

确定单个基因的功能 147

个例研究：标注酿酒酵母基因组序列 160

总结 163

第6章 理解基因组是如何行使功能的 169

转录组研究 170

蛋白质组研究 176

蛋白质组之外 188

总结 190

第2篇 基因组结构 199

第7章 真核生物核基因组 199

核基因组包含于染色体当中 200

真核生物核基因组的遗传特征 206

总结 221

第8章 原核生物基因组和真核生物细胞器基因组 227

原核生物基因组的物理特征 228

原核生物基因组的遗传学特征 232

真核生物细胞器基因组 239

总结 243

第9章 病毒基因组和可移动的遗传元件 249

噬菌体和真核生物病毒的基因组 250

可移动的遗传元件 257

总结 264

第3篇 基因组如何行使功能 273

第10章 接近基因组 273

细胞核内部 274

染色质修饰和基因组表达 281

DNA修饰和基因组表达 287

总结 291

第11章 转录起始复合物的组装 297

DNA结合蛋白及其结合位点 299

转录起始中DNA-蛋白质的相互作用 310

转录起始的调控 317

总结 326

第12章 RNA的合成和加工 333

细菌RNA的合成和加工 334

真核细胞RNA的合成和加工 346

总结 373

第13章 蛋白质组的合成与加工 381

tRNA在蛋白质合成中的作用 382

核糖体在蛋白质合成中的作用 388

蛋白质翻译后加工 401

蛋白质降解 409

总结 410

第14章 基因组活性的调控 417

基因组活性的瞬时变化 419

基因组活性的永久性和半永久性变化 430

发育过程中基因组活性的调节 436

总结 448

第4篇 基因组如何复制及进化 457

第15章 基因组复制 457

拓扑学问题 458

复制过程 464

真核生物基因组复制的调控 481

总结 486

第16章 突变和DNA修复 493

突变 494

DNA修复 510

总结 519

第17章 重组 526

同源重组 527

位点特异性重组 534

转座 536

总结 540

第18章 基因组如何进化 546

基因组：最初的100亿年 547

新基因的获得 551

非编码DNA与基因组进化 563

人类基因组：最近的500万年 567

总结 568

第19章 分子系统发生学 575

从分类学到分子系统发生学 576

基于DNA的系统发生树的重建 579

分子系统发生学的应用 589

总结 598

附录 604

词汇表 626

索引 660