- 作 者：刘旭光，张杰编著
- 出 版 社：北京：北京大学医学出版社
- 出版年份：2007
- ISBN：7811161281
- 标注页数：276 页
- PDF页数：288 页
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第一部分 核酸序列分析 3
1 序列检索与格式转换 3
1.1 序列检索 3
1.2 序列格式简介 7
1.3 格式转换 16
2 一级结构分析 23
2.1 组成成分分析 23
2.2 重复序列 27
2.3 序列变换 29
3 克隆 33
3.1 酶切位点查找 33
3.2 模拟电泳 47
3.3 电泳图像分析 52
3.4 质粒绘图 57
3.5 克隆策略与过程显示 67
4 引物设计 70
4.1 引物设计的基本原则 70
4.2 引物设计与分析 74
4.3 高通量引物与探针设计 106
5 测序拼装 111
5.1 测序图分析 111
5.2 测序拼装 115
6 DNA功能分析 122
6.1 ORF查找与翻译 122
6.2 Motif查找 135
7 RNA二级结构预测 138
7.1 RNAstructure 138
7.2 RNAdraw 142
7.3 DNAstar 145
第二部分 蛋白质序列分析 145
1 理化性质分析 149
1.1 蛋白酶酶切特性 149
1.2 滴定曲线与等电点 152
1.3 亲水性和疏水性 155
1.4 电荷密度 159
2 二级结构预测 161
2.1 DNAstar 161
2.2 Vector NTI Advance 163
2.3 ANTHEPROT 165
3 其他特殊局部结构分析 167
3.1 膜蛋白的跨膜螺旋 167
3.2 信号肽 169
3.3 卷曲螺旋 170
3.4 抗原决定簇 170
4 三维分子显示 173
4.1 RasMol 173
4.2 Vector NTI Advance 175
4.3 Cn3D 178
第三部分 序列比对及进化树 178
1 BLAST 187
1.1 BLAST简介 187
1.2 BLAST实践 190
1.3 BLAST高级选项 192
2 本地BLAST 194
3 多序列之间的两两比对与进化树分析 197
3.1 ClustalX 198
3.2 DNAstar 202
3.3 Vector NTI Advance 207
3.4 PHYLIP 208
第四部分 文献管理与引用 208
1 文献管理 217
1.1 Reference Manager 217
1.2 EndNote 229
1.3 NoteExpress 239
1.4 全文查找 244
2 在Word中引用文献 247
2.1 Reference Manager 247
2.2 EndNote 255
2.3 NoteExpress 261
附录1 软件简介 266
附录2 参考文献 271