本草基因组学

上篇 2

第一章 绪论 2

第一节 本草基因组学的产生和发展 3

第二节 本草基因组学研究内容 10

第三节 本草基因组学的应用 13

参考文献 15

第二章 结构基因组学研究策略 18

第一节 核基因组研究策略 19

第二节 叶绿体基因组研究策略 22

第三节 线粒体基因组研究策略 24

参考文献 27

第三章 药用生物核基因组 28

第一节 人参基因组 28

第二节 灵芝基因组 30

第三节 丹参基因组 35

第四节 长春花基因组 38

第五节 铁皮石斛基因组 39

参考文献 47

第四章 药用生物细胞器基因组 49

第一节 药用植物叶绿体基因组 49

第二节 药用生物线粒体基因组 54

参考文献 61

第五章 功能基因组学——药用生物转录组研究 64

第一节 转录组研究策略 64

第二节 药用植物转录组 70

第三节 药用动物转录组 82

第四节 药用真菌转录组 83

参考文献 87

第六章 功能基因组学——药用生物蛋白质组研究 91

第一节 药用植物蛋白质组 91

第二节 药用动物蛋白质组 97

参考文献 100

第七章 功能基因组学——药用植物代谢组研究 102

第一节 药用植物代谢组研究策略 103

第二节 基于代谢组学的中药鉴定和质量评价 107

第三节 基于代谢组学的天然产物合成研究 114

参考文献 119

第八章 功能基因组学——天然产物生物合成途径解析 121

第一节 天然产物生物合成途径研究策略 122

第二节 萜类生物合成途径 126

第三节 生物碱类生物合成途径 134

第四节 黄酮类生物合成途径 141

参考文献 145

第九章 表观基因组学 151

第一节 表观基因组研究策略 151

第二节 非编码RNA 157

第三节 DNA甲基化 164

参考文献 170

第十章 药用生物宏基因组学 175

第一节 药用生物宏基因组学研究策略 175

第二节 药用植物根际微生物宏基因组 180

第三节 药用植物内生菌宏基因组 190

参考文献 193

下篇 196

第十一章 药用模式生物研究 196

第一节 药用模式生物研究策略 197

第二节 药用模式真菌——灵芝 203

第三节 药用模式植物——丹参 210

参考文献 221

第十二章 中药合成生物学研究 228

第一节 中药合成生物学体系创建 229

第二节 中药合成生物学体系优化策略 232

第三节 萜类合成生物学 238

第四节 生物碱合成生物学 242

第五节 黄酮合成生物学 247

参考文献 251

第十三章 药用植物分子育种研究 257

第一节 药用植物分子育种原理与方法 257

第二节 优质高产药用植物分子育种 261

第三节 抗逆药用植物分子育种 268

参考文献 272

第十四章 中药分子鉴定 275

第一节 DNA条形码鉴定 275

第二节 超级条形码鉴定 290

第三节 其他分子鉴定技术 293

参考文献 297

第十五章 药物体内过程组学研究 300

第一节 中药药物基因组学 300

第二节 中药肠道宏基因组学 307

第三节 中药药物蛋白质组学 314

第四节 中药药物代谢组学 319

参考文献 322

第十六章 本草基因组学关键实验技术 329

第一节 结构基因组学关键技术 329

第二节 基因功能研究关键技术 335

第三节 蛋白质组学关键技术 337

第四节 代谢组学关键技术 340

第五节 合成生物学关键技术 342

参考文献 344

第十七章 生物信息学及数据库 347

第一节 生物信息学编程基础 348

第二节 生物信息学常用分析方法 349

第三节 基因组相关数据库 353

参考文献 360

核心参考文献 362

主要名词中英文对照表 364