分子流行病学研究与系统评价 Meta分析

第一章 分子流行病学研究相关知识 1

第一节 分子流行病学的研究内容 3

第二节 分子流行病学的生物学标志 4

第三节 单核苷酸多态性 6

第四节 分子流行病学的研究设计 9

第五节 常用的技术方法 10

第六节 哈迪温伯格平衡 11

第二章 分子流行病学研究相关数据库介绍 17

第一节 PDGene数据库 19

第二节 ImMunoGeneTics数据库 21

第三节 Immuno Polymorphism数据库 23

第四节 Human Gene Mutation数据库 28

第五节 HuGE Nayigator数据库 30

第六节 PrognoScan数据库 33

第七节 PROGgeneV2数据库 38

第三章 分子流行病学研究报告规范 43

第一节 加强观察性流行病学研究报告质量规范 45

第二节 加强遗传学关联研究报告规范 49

第三节 肿瘤标志物预后研究报告规范 52

第四节 加强遗传风险预测研究规范 54

第五节 加强免疫基因组学研究的报告规范 57

第六节 加强传染性疾病的分子流行病学报告规范 59

第四章 分子流行病学研究方法学质量评价工具 65

第一节 方法学质量评价工具现状 67

第二节 随机试验的方法学质量评价工具 67

第三节 非随机试验的方法学质量评价工具 70

第四节 分析性研究的方法学质量评价工具 72

第五节 病例系列的方法学质量评价工具 74

第六节 诊断准确性试验方法学质量评价工具 76

第五章 分子流行病学研究系统评价/Meta分析方法 79

第一节 系统评价/Meta分析的内涵 81

第二节 系统评价/Meta分析的制作步骤 84

第三节 Meta分析的效应量与模型 90

第四节 Meta分析的图形解读 92

第五节 基因表达基因芯片数据的Meta分析 94

第六章 遗传关联性研究的Meta分析方法 107

第一节 Meta分析的分类及制作要点 109

第二节 Meta分析中对HWE的处理 110

第三节 Meta分析的异质性来源 110

第四节 Meta分析的多重检验校正方法 114

第五节 Meta分析基因模型的选择 118

第七章 分子流行病学研究系统评价/Meta分析报告规范 127

第一节 报告规范的产生背景 129

第二节 系统评价与Meta分析优先报告条目 130

第三节 观察性研究Meta分析的报告规范 132

第四节 人类基因组流行病学网络指南 134

第五节 PLoS One遗传关联性研究Meta分析的清单 139

第六节 Sagoo等的标准 140

第八章 分子流行病学研究文献检索方法 143

第一节 检索常用方法和途径 145

第二节 资源类型及检索策略设计 147

第三节 PubMed数据库及实际操作举例 150

第四节 Embase数据库及实际操作举例 158

第五节 SCI数据库及实际操作举例 164

第六节 全文获取方案及注意事项 167

第九章 分子流行病学研究系统评价/Meta分析选题 173

第一节 选题的基本要素 175

第二节 检索注册平台选题 176

第三节 选题实例剖析 183

第十章 PROSPERO注册平台及示例 197

第一节 注册特点及范围 199

第二节 研究方案的组成及注册实例展示 202

第三节 注册平台的检索 221

第十一章 病因性研究系统评价/Meta分析案例剖析 227

第一节 单核苷酸多态性与疾病易感性/严重程度 229

第二节 甲基化与疾病易感性/严重程度 238

第三节 基因多态性与药物功效 244

第四节 多重检验校正之假阳性结果报告率法 264

第五节 方法学研究 282

第六节 全基因组关联研究 293

第七节 基因芯片研究 332

第八节 基因多态性与疾病的诊断 338

第十二章 应用Stata软件实现Meta分析 347

第一节 Stata软件操作简介 349

第二节 Stata软件实现Meta分析的方法 353

第三节 数据准备及实现分析 360

第十三章 应用R软件实现Meta分析 375

第一节 程序包安装、加载及卸载 377

第二节 数据集创建、读取与图形参数设定 382

第三节 应用meta程序包实现 389

第四节 应用metafor程序包实现 400

第五节 应用rmeta程序包实现 418

第六节 应用MetaOmics程序包 426

第十四章 应用非编程软件实现Meta分析 433

第一节 应用RevMan 5.3软件实现 435

第二节 应用Comprehensive Meta-Analysis软件实现 451