超循环论

作者为中译本写的序 1

超循环：一个自然的自组织原理 艾根 舒斯特 1

前言 3

1 超循环的出现 9

1.1 进化中的统一性和多样性规范 9

1.2 什么是超循环？ 11

1.3 达尔文系统 20

1.4 误差阈和进化 42

2.1 具体的问题 61

2 抽象的超循环 61

2.2 动力学系统的一般分类 69

2.3 自组织反应网络的固定点分析 77

2.4 基本超循环的动力学 106

2.5 超循环与翻译 119

2.6 超循环网络 128

3 现实的超循环 142

3.1 怎样开始翻译？ 142

3.2 原始编码的逻辑 147

3.3 原始编码的物理学 154

3.4 GC配对密码 161

3.5 早期翻译器中的超循环组织 170

3.6 十个问题 179

3.7 现实的边界条件 196

3.8 进化的连续性 202

物质的自组织和生物大分子的进化 艾根 208

1 导言 209

1.1 “因和果” 209

1.2 自组织的前提 212

2.1 “信息”概念 230

2 唯象的选择理论 230

2.2 唯象方程 233

2.3 选择约束 239

2.4 选择平衡 245

2.5 品质因子和误差分布 249

2.6 选择动力学 253

3 选择的随机处理 263

3.1 决定论选择理论的局限 263

3.2 平衡态附近的涨落 264

3.3 定态的涨落 266

3.4 马尔科夫链的随机模型 270

3.5 三种选择原型的定量讨论 274

4 基于互补识别的自组织：核酸 281

4.1 真实的“自我指令” 281

4.2 互补指令和选择(理论) 286

4.3 互补碱基识别(实验数据) 291

5 通过循环催化的自组织：蛋白质 304

5.1 酶的识别和催化 304

5.2 自组织的酶循环(理论) 307

5.3 蛋白质能复制出自已吗？ 315

6.1 核酸和蛋白质需要协同作用 320

6 通过编码催化功能的自我有序 320

6.2 自复制的超循环 322

6.3 关于密码起源 333

7 进化实验 343

7.1 Qβ复制酶系统 343

7.2 试管中的达尔文进化 345

7.3 定量的选择研究 349

7.4 “独缺”实验 352

8 结论 354

8.1 理论的限度 354

8.2 “价值”概念 355

8.3 “耗散”和“信息起源” 358

8.4 选择和进化的原理 361

8.5 “非决定”但“不可避免” 363

8.6 生命现象能够用现在的物理学概念加以解释吗？ 367

9 总结 369

生物信息的起源 艾根 375

1 问题和伪问题 377

2 生物的复杂性和特殊性 379

3 “生命博奕” 387

4.1 稳定性和选择 395

4 达尔文和分子 395

4.2 随机模型 398

4.3 唯象表示 402

4.4 进化实验 407

5 实在和模型 410

5.1 真实自复制 411

5.2 互补指令 412

5.3 循环催化 415

5.4 超循环 417

6 一些回答 426